A livello chimico non vedo controindicazioni
preciso che non sono un esperto di limoni ma di uve
se metti le bucce in congelatore, fai quello che in enologia è chiamata una supra-estrazione a freddo o crio-estrazione:
il meccanismo è semplice, mettendo le tue bucce in congelatore, l'acqua delle cellule della buccia congela, quindi aumenta di volume, fino a rompere le pareti cellulari...
ciò che ne ottieni è semplicemente un'estrazione più rapida dei composti della buccia, durante la macerazione
Il solo accorgimento che ti consiglio, consiste nell'abbreviare il periodo di macerazione in alcol, quando vorrai fare il tuo limoncello (man mano che la macerazione avanza, assaggialo, per assicurarti di non estrarre troppo)
per il resto, no problem!